Unter Windows - > Preferences → Jaspersoft Studio können Sie verschiedene Einstellungen vornehmen. Wichtig in der Menüpunkt "Compatibility": wählen Sie dort die JR-Version, die auch Ihre Ziel-Platform enthält.
Im Dateimanager von JasperSoft Studio gibt es Eclipse-typisch ein "virtuelles" Dateisystem mit dem Standardnamen "MyReports", zumindest beim Speichern von Dateien. Dieses Dateisystem liegt physisch im Ordner <<Home-Verzeichnis>>/JaspersoftWorkspace/MyReports.
Beim Öffnen von Dateien können Sie direkt mit "Open File" aufs normale Dateisystem zugreifen.